В декабре 1994 года для проведения первоначальной подготовки курсантского состава и осуществления безопасной и эффективной летной эксплуатации воздушных судов был создан первый летный отряд.

У истоков организации летного отряда стояли: В.В.Сырвачев, В.В.Пырков, Б.Н.Рознин, И.Е.Асманкин, В.М.Стефанович, Е.И.Парнюк, Г.Н.Дегтярь, С.Н.Гаврилин.

В настоящие время 1-й летный отряд возглавляет В.В. Пырков, пилот первого класса. Его ближайшие помощники : Д.М.Кочегаров, С.Ю.Харитонов, Е.И. Парнюк, Е.Ю.Тютин, Н.В.Берестовой, А.А.Абрамов, В.В.Каюк, С.Н.Ивасев.

В январе 1995 года в отряде началось теоретическое переучивание летно-инструкторского состава на самолете Як-18Т. В мае 1995 года в училище поступили первые пять самолетов Як-18Т с авиационного завода в г. Смоленске.

В июне 1995 года начались полеты летно-инструкторского состава. В августе 1995 года начались первые учебные полеты с курсантами, а в апреле 1996 года – регулярные учебные полеты. В мае 1996 года выполнен первый самостоятельный полет курсантом.

В октябре 1996 года началось теоретическое переучивание постоянного летно-инструкторского состава третьей авиационной эскадрильи училища на выпускной самолет Ан-26. В июле 1997 года начались первые полеты курсантов на самолете Ан-26, а в июле 1999 года - первые полеты на самолете Як-40.

В ноябре 2005 года командно-летный и летный состав 1-го летного отряда приступил к освоению самолета М-101Т, на котором планировалось обучение курсантского состава. В 2009 году впервые в истории гражданской авиации России курсанты, подготовленные лётным составом первого отряда выполнили самостоятельные полёты на этом типе самолёта.

В начале 2008 года лётным составом отряда был освоен самолёт Як-18Т (36 серии). В сентябре этого же года лётно-инструкторский состав приступил к обучению курсантов училища на этом типе.

За время существования первого летного отряда командирами воздушных судов-инструкторами – «даны путевки» в небо 373 пилотам, подготовленным по методикам, ориентированным на стандарты ИКАО .

Училище выпускает специалистов согласно международной классификации пилотов коммерческой авиации, то есть пилотов, способных по уровню своих знаний, подготовке и практике работать и на коммерческих, и на чартерных авиалиниях. Выпускники училища успешно работают в различных авиакомпаниях России и стран ближнего зарубежья.

Большое внимание в работе первого летного отряда уделяется профессиональной подготовке постоянного летного состава. Высококлассными специалистами, воспитанными в летном отряде, укомплектовывается летно-методический центр ГА РФ, экипажи третьего летного отряда и лётного подразделения училища.

В училище проведена большая работа по подготовке летно-методической базы, накоплен значительный опыт ее работы, который передается от более опытных инструкторов к начинающим, что положительно сказывается на качестве подготовки авиационных специалистов.